Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX4O95219 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX4O95219 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms