Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRPM2O94759 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms