Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA4O75676 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms