Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAP30O75446 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAP30O75446 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAP30O75446 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAP30O75446 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAP30O75446 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms