Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG13O75143 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG13O75143 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG13O75143 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG13O75143 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG13O75143 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms