Protein–RNA interactions for Protein: O60543

CIDEA, Cell death activator CIDE-A, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEAO60543 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIDEAO60543 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIDEAO60543 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms