Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms