Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1GO43497 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1GO43497 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1GO43497 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1GO43497 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1GO43497 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1GO43497 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1GO43497 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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