Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms