Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms