Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VGFO15240 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VGFO15240 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
VGFO15240 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VGFO15240 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGFO15240 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGFO15240 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGFO15240 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGFO15240 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGFO15240 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGFO15240 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
VGFO15240 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGFO15240 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms