Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms