Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APAF1O14727 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APAF1O14727 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APAF1O14727 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APAF1O14727 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APAF1O14727 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APAF1O14727 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APAF1O14727 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APAF1O14727 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APAF1O14727 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APAF1O14727 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APAF1O14727 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APAF1O14727 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms