Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX7O00628 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX7O00628 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX7O00628 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX7O00628 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX7O00628 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms