Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIEO00221 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms