Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SMAPO00193 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAPO00193 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAPO00193 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAPO00193 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAPO00193 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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