Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QR89 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QR89 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QR89 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QR89 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QR89 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QR89 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QR89 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QR89 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QR89 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QR89 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QR89 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms