Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms