Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85CA6NKD9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms