Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms