Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms