Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB19A4D1S5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms