Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC78A2IDD5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms