Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CELF2-205ENST00000542579 7982 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MYH11-203ENST00000452625 6886 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SPECC1-205ENST00000395529 4971 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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