Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf44-201ENST00000317019 3547 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ACAD10-201ENST00000313698 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFB5-214ENST00000493866 4046 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 DENND1B-201ENST00000235453 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CDV3-202ENST00000420115 3621 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 GAREM1-201ENST00000269209 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AL137145.1-201ENST00000391437 2447 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM108-AS1-202ENST00000505721 2427 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 TTC23-201ENST00000262074 3316 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ACSL6-203ENST00000379240 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 BRDT-203ENST00000370389 3696 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 THUMPD3-201ENST00000345094 3961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 POGLUT1-201ENST00000295588 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 AMIGO2-203ENST00000550413 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP20-1Q3LI63 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms