Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms