Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP002008.3-201ENST00000528614 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AFF2-205ENST00000370460 13746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 GIT2-209ENST00000547815 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 HAPLN1-201ENST00000274341 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 ZNF619-202ENST00000429348 4104 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 MMP3-201ENST00000299855 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 DIS3L-201ENST00000319194 3763 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AP002439.1-201ENST00000588204 480 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC073534.1-201ENST00000598671 1056 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC091304.1-201ENST00000564897 3034 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 PRICKLE1-205ENST00000548696 3635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC108215.1-201ENST00000624463 3226 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 FYN-229ENST00000538466 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRHP20396 SCMH1-204ENST00000361705 3115 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 C11orf57-202ENST00000393047 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 SOX9-AS1-217ENST00000623935 1563 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 CD44-210ENST00000434472 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL023755.1-202ENST00000636459 1665 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 OR8D4-202ENST00000641687 2904 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 SEZ6L-205ENST00000403121 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 MTND6P21-201ENST00000443620 482 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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TRHP20396 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC004893.1-201ENST00000442161 1393 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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TRHP20396 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 TMEM55A-201ENST00000285419 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 CCDC170-201ENST00000239374 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 CCR4-201ENST00000330953 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPAP1-202ENST00000561603 3906 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 SLC6A15-201ENST00000266682 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC007238.1-201ENST00000434096 1741 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 ABRAXAS1-206ENST00000506553 1869 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 R3HDM2-202ENST00000358907 3974 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 GTF2IP20-202ENST00000608760 2046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 NLRP3-201ENST00000336119 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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