Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUBP2Q9Y5Y2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms