Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms