Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y315

DERA, Deoxyribose-phosphate aldolase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERAQ9Y315 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DERAQ9Y315 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DERAQ9Y315 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DERAQ9Y315 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DERAQ9Y315 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms