Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF5Q9Y2D1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms