Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms