Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms