Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNND2Q9UQB3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms