Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms