Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms