Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RABGEF1Q9UJ41 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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RABGEF1Q9UJ41 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RABGEF1Q9UJ41 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RABGEF1Q9UJ41 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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