Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms