Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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