Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFIP11Q9UBB9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFIP11Q9UBB9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFIP11Q9UBB9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFIP11Q9UBB9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFIP11Q9UBB9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms