Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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