Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1C1Q9NYB5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1C1Q9NYB5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1C1Q9NYB5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms