Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALKBH4Q9NXW9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms