Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms