Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN6Q9NWW5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms