Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A1Q9NWF4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A1Q9NWF4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms