Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms