Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms