Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms