Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms